生态经济与可持续发展研究所以生态系统为研究对象，从经济学角度研究能源、生态系统与经济系统的相互关系、最优配置与可持续发展的学科。其内容涵盖能源、生态和经济的关系，能源与生态资源的最优配置、能源市场与监管、能源经济与政策制定、能源安全、低碳经济与循环经济、生态与经济协调发展、生态资源价值评估、生态产业发展等。
本研究所已围绕资源可持续发展、环境保护与经济发展等国家重大需求问题及学科前沿问题展开了长期科学研究合作，形成了良好的凝聚力与团队意识。团队科研氛围浓厚，成员分工明确，清楚自身在团队中的角色与任务。团队成员既有学科领域知名学者，也有新锐力量，能够聚焦本领域内的重大科学问题展开高效协同工作。因此本研究所的成立，将能够有效支撑应用经济学学科建设，突出学院学科建设的特色。
近年来，研究所研究方向特色鲜明，集聚创新力量，面向国家生态文明建设战略需求，面向生态经济建设开展科研攻关，并已在碳达峰碳中和产业领域（新能源、制造业等）、水生态文明建设等研究方向取得了较丰硕的研究成果。在《管理世界》、《中国工业经济》和《Energy》等高质量期刊发表近百篇论文，出版著作15余部。研究成果获得江苏省科技奖励、哲社奖等20多项，多项咨询报告和资政报告获得省市级政府领导批示和主管部门采纳，多项专报及建议转化为政府的政策并付诸实施，具有良好的社会影响力。
